Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
VdrP48281 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
VdrP48281 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
VdrP48281 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
VdrP48281 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
VdrP48281 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
VdrP48281 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
VdrP48281 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
VdrP48281 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
VdrP48281 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm24257-201ENSMUST00000104472 131 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm11220-201ENSMUST00000118844 475 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm40614-201ENSMUST00000125161 1254 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Fam136b-ps-201ENSMUST00000068987 412 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Blvrb-203ENSMUST00000108358 951 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms