Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Rpl28P41105 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpl28P41105 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms