Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fcer1aP20489 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fcer1aP20489 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms