Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
P10404 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
P10404 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
P10404 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
P10404 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
P10404 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
P10404 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
P10404 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
P10404 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
P10404 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
P10404 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
P10404 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
P10404 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
P10404 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
P10404 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms