Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms