Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Hsd17b3-204ENSMUST00000222783 1184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20795J3QP49 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms