Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-M1F7CXU4 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms