Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28048F7BCN0 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28048F7BCN0 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28048F7BCN0 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28048F7BCN0 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28048F7BCN0 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28048F7BCN0 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28048F7BCN0 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28048F7BCN0 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms