Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3238W4VSP7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms