Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5114W4VSN8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5114W4VSN8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms