Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd2V9GX34 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd2V9GX34 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms