Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria3Q9Z2W9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria3Q9Z2W9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms