Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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