Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Crlf3Q9Z2L7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crlf3Q9Z2L7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms