Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms