Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ror1Q9Z139 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ror1Q9Z139 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms