Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms