Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp4Q9WV89 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp4Q9WV89 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms