Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme3Q9WV85 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme3Q9WV85 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms