Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnip1Q9WUU8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms