Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stub1Q9WUD1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms