Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PplQ9R269 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PplQ9R269 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PplQ9R269 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PplQ9R269 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PplQ9R269 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PplQ9R269 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PplQ9R269 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PplQ9R269 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PplQ9R269 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PplQ9R269 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PplQ9R269 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms