Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vav3Q9R0C8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav3Q9R0C8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav3Q9R0C8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav3Q9R0C8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav3Q9R0C8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav3Q9R0C8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav3Q9R0C8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav3Q9R0C8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav3Q9R0C8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav3Q9R0C8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav3Q9R0C8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav3Q9R0C8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav3Q9R0C8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vav3Q9R0C8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav3Q9R0C8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms