Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AmfrQ9R049 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms