Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Opn4Q9QXZ9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms