Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx8Q9QXV1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms