Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cln8Q9QUK3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms