Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk1eQ9JMK2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk1eQ9JMK2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms