Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cabp1Q9JLK7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cabp1Q9JLK7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms