Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp2Q9JLK4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp2Q9JLK4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms