Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm1Q9JLF6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms