Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtsmQ9JL96 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsmQ9JL96 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtsmQ9JL96 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms