Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gde1Q9JL56 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gde1Q9JL56 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms