Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trem3Q9JKE1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trem3Q9JKE1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem3Q9JKE1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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