Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ybx3Q9JKB3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ybx3Q9JKB3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ybx3Q9JKB3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms