Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd3Q9JJY3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd3Q9JJY3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms