Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms