Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfhx4Q9JJN2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms