Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc86Q9JJ89 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc86Q9JJ89 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc86Q9JJ89 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc86Q9JJ89 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc86Q9JJ89 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc86Q9JJ89 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc86Q9JJ89 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc86Q9JJ89 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc86Q9JJ89 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc86Q9JJ89 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc86Q9JJ89 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc86Q9JJ89 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc86Q9JJ89 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms