Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RabggtaQ9JHK4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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