Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Brd4Q9ESU6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Brd4Q9ESU6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms