Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rb1cc1Q9ESK9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms