Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESE1

Lrba, Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrbaQ9ESE1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LrbaQ9ESE1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LrbaQ9ESE1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms