Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlnrd1Q9ERE8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlnrd1Q9ERE8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms