Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ7

Rims2, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims2Q9EQZ7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rims2Q9EQZ7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rims2Q9EQZ7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms