Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp3a44Q9EQW4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp3a44Q9EQW4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp3a44Q9EQW4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms