Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r44Q9EQ47 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r44Q9EQ47 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms