Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlr1Q9EPQ1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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