Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx6Q9DBY5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx6Q9DBY5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms