Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf6Q9DBU5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms